Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SGCAQ16586 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SGCAQ16586 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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SGCAQ16586 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
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SGCAQ16586 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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SGCAQ16586 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
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SGCAQ16586 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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SGCAQ16586 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SGCAQ16586 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
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