Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CDK16Q00536 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDK16Q00536 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms