Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GTF2BQ00403 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF2BQ00403 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms