Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOBP62745 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOBP62745 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
RHOBP62745 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOBP62745 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
RHOBP62745 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RHOBP62745 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RHOBP62745 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RHOBP62745 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RHOBP62745 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOBP62745 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOBP62745 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOBP62745 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
RHOBP62745 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
RHOBP62745 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
RHOBP62745 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms