Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SNX16P57768 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SNX16P57768 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SNX16P57768 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX16P57768 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SNX16P57768 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SNX16P57768 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SNX16P57768 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms