Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP3M2P53677 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms