Protein–RNA interactions for Protein: P52735

VAV2, Guanine nucleotide exchange factor VAV2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV2P52735 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VAV2P52735 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VAV2P52735 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VAV2P52735 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VAV2P52735 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VAV2P52735 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VAV2P52735 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAV2P52735 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAV2P52735 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VAV2P52735 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VAV2P52735 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VAV2P52735 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
VAV2P52735 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms