Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RGS4P49798 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RGS4P49798 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RGS4P49798 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RGS4P49798 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
RGS4P49798 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RGS4P49798 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RGS4P49798 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RGS4P49798 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGS4P49798 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGS4P49798 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RGS4P49798 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms