Protein–RNA interactions for Protein: P35241

RDX, Radixin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDXP35241 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RDXP35241 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RDXP35241 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RDXP35241 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RDXP35241 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RDXP35241 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RDXP35241 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RDXP35241 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RDXP35241 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms