Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HOXA5P20719 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXA5P20719 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms