Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F9P00740 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
F9P00740 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
F9P00740 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F9P00740 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F9P00740 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F9P00740 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
F9P00740 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
F9P00740 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
F9P00740 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms