Protein–RNA interactions for Protein: O00294

TULP1, Tubby-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP1O00294 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP1O00294 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP1O00294 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP1O00294 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP1O00294 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TULP1O00294 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TULP1O00294 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TULP1O00294 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TULP1O00294 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TULP1O00294 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TULP1O00294 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TULP1O00294 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TULP1O00294 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TULP1O00294 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TULP1O00294 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TULP1O00294 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP1O00294 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP1O00294 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP1O00294 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP1O00294 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP1O00294 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP1O00294 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TULP1O00294 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms