Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
J3QKU1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
J3QKU1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
J3QKU1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
J3QKU1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
J3QKU1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
J3QKU1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
J3QKU1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
J3QKU1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
J3QKU1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3QKU1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3QKU1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3QKU1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3QKU1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
J3QKU1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
J3QKU1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QKU1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QKU1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QKU1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QKU1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QKU1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
J3QKU1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms