Protein–RNA interactions for Protein: V9GYQ6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYQ6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
V9GYQ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
V9GYQ6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
V9GYQ6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
V9GYQ6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
V9GYQ6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
V9GYQ6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
V9GYQ6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
V9GYQ6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
V9GYQ6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
V9GYQ6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
V9GYQ6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
V9GYQ6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
V9GYQ6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GYQ6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
V9GYQ6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GYQ6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GYQ6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GYQ6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
V9GYQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
V9GYQ6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
V9GYQ6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GYQ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GYQ6 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GYQ6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GYQ6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
V9GYQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
V9GYQ6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
V9GYQ6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GYQ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
V9GYQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
V9GYQ6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GYQ6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
V9GYQ6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
V9GYQ6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
V9GYQ6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
V9GYQ6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
V9GYQ6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
V9GYQ6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
V9GYQ6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
V9GYQ6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GYQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
V9GYQ6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GYQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GYQ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GYQ6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
V9GYQ6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
V9GYQ6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GYQ6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GYQ6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
V9GYQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
V9GYQ6 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GYQ6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GYQ6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GYQ6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
V9GYQ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
V9GYQ6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
V9GYQ6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GYQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
V9GYQ6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GYQ6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GYQ6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GYQ6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GYQ6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
V9GYQ6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GYQ6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GYQ6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GYQ6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GYQ6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GYQ6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
V9GYQ6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
V9GYQ6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GYQ6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
V9GYQ6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
V9GYQ6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GYQ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GYQ6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
V9GYQ6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GYQ6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
V9GYQ6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
V9GYQ6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
V9GYQ6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
V9GYQ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
V9GYQ6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
V9GYQ6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
V9GYQ6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
V9GYQ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
V9GYQ6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
V9GYQ6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
V9GYQ6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
V9GYQ6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
V9GYQ6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
V9GYQ6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
V9GYQ6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
V9GYQ6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
V9GYQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
V9GYQ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
V9GYQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
V9GYQ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
V9GYQ6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms