Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.38■■■■□ 3.9
SETBP1Q9Y6X0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
SETBP1Q9Y6X0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC39.37■■■■□ 3.89
SETBP1Q9Y6X0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.34■■■■□ 3.89
SETBP1Q9Y6X0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
SETBP1Q9Y6X0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.33■■■■□ 3.89
SETBP1Q9Y6X0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
SETBP1Q9Y6X0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.31■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.26■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
SETBP1Q9Y6X0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.25■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.24■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.22■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC39.2■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.2■■■■□ 3.87
SETBP1Q9Y6X0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.18■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.17■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.16■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.16■■■■□ 3.86
SETBP1Q9Y6X0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.13■■■■□ 3.85
SETBP1Q9Y6X0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.13■■■■□ 3.85
SETBP1Q9Y6X0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
SETBP1Q9Y6X0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SETBP1Q9Y6X0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
SETBP1Q9Y6X0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
SETBP1Q9Y6X0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
SETBP1Q9Y6X0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.06■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.05■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.04■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.04■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.03■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.03■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.02■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.01■■■■□ 3.84
SETBP1Q9Y6X0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3.83
SETBP1Q9Y6X0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC38.99■■■■□ 3.83
SETBP1Q9Y6X0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC38.98■■■■□ 3.83
SETBP1Q9Y6X0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.95■■■■□ 3.83
SETBP1Q9Y6X0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.9■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
SETBP1Q9Y6X0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
SETBP1Q9Y6X0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SETBP1Q9Y6X0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SETBP1Q9Y6X0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SETBP1Q9Y6X0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SETBP1Q9Y6X0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC38.8■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SETBP1Q9Y6X0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
SETBP1Q9Y6X0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SETBP1Q9Y6X0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
SETBP1Q9Y6X0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC38.66■■■■□ 3.78
SETBP1Q9Y6X0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
SETBP1Q9Y6X0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
SETBP1Q9Y6X0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
SETBP1Q9Y6X0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms