Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC53.65■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC53.65■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC53.65■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC53.62■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC53.6■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC53.58■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC53.57■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
DCAF1Q9Y4B6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC53.52■■■■■ 6.16
DCAF1Q9Y4B6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC53.52■■■■■ 6.16
DCAF1Q9Y4B6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC53.5■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC53.48■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC53.48■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC53.46■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC53.46■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC53.46■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC53.44■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC53.32■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.32■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC53.29■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC53.26■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC53.25■■■■■ 6.11
DCAF1Q9Y4B6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC53.25■■■■■ 6.11
DCAF1Q9Y4B6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC53.15■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.15■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC53.11■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.1■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC53.1■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC53.06■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC53.01■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC53.01■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC52.98■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.97■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC52.95■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC52.94■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC52.93■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.91■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC52.89■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.87■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC52.83■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.83■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.8■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC52.76■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC52.75■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.74■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC52.72■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC52.72■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC52.71■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC52.71■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC52.7■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.69■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC52.69■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC52.69■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC52.67■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC52.66■■■■■ 6.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms