Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC53.65■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC53.65■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC53.65■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.63■■■■■ 6.18
DCAF1Q9Y4B6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC53.62■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC53.6■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC53.58■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC53.57■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC53.57■■■■■ 6.17
DCAF1Q9Y4B6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC53.53■■■■■ 6.16
DCAF1Q9Y4B6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC53.52■■■■■ 6.16
DCAF1Q9Y4B6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC53.52■■■■■ 6.16
DCAF1Q9Y4B6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC53.5■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC53.48■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC53.48■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC53.47■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC53.46■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC53.46■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC53.46■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC53.44■■■■■ 6.15
DCAF1Q9Y4B6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.42■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.39■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC53.38■■■■■ 6.14
DCAF1Q9Y4B6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC53.35■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.33■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC53.32■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.32■■■■■ 6.13
DCAF1Q9Y4B6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC53.31■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC53.29■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC53.28■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.26■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC53.26■■■■■ 6.12
DCAF1Q9Y4B6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC53.25■■■■■ 6.11
DCAF1Q9Y4B6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC53.25■■■■■ 6.11
DCAF1Q9Y4B6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC53.17■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.16■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC53.15■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.15■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.14■■■■■ 6.1
DCAF1Q9Y4B6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC53.11■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC53.11■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.1■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC53.1■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.08■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.07■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.09
DCAF1Q9Y4B6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.06■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC53.06■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.02■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC53.01■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC53.01■■■■■ 6.08
DCAF1Q9Y4B6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC52.98■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.97■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC52.95■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC52.95■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.94■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC52.94■■■■■ 6.07
DCAF1Q9Y4B6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC52.93■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.92■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.91■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.91■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.89■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC52.89■■■■■ 6.06
DCAF1Q9Y4B6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.87■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC52.86■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC52.83■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.83■■■■■ 6.05
DCAF1Q9Y4B6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC52.81■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC52.8■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.77■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC52.76■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC52.75■■■■■ 6.04
DCAF1Q9Y4B6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC52.75■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.74■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC52.72■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC52.72■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC52.71■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC52.71■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC52.7■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC52.69■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC52.69■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC52.69■■■■■ 6.03
DCAF1Q9Y4B6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC52.67■■■■■ 6.02
DCAF1Q9Y4B6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC52.66■■■■■ 6.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms