Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y490

TLN1, Talin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLN1Q9Y490 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TLN1Q9Y490 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLN1Q9Y490 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TLN1Q9Y490 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLN1Q9Y490 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLN1Q9Y490 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TLN1Q9Y490 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TLN1Q9Y490 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TLN1Q9Y490 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TLN1Q9Y490 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TLN1Q9Y490 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TLN1Q9Y490 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TLN1Q9Y490 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
TLN1Q9Y490 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TLN1Q9Y490 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TLN1Q9Y490 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms