Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3T6

R3HCC1, R3H and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HCC1Q9Y3T6 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
R3HCC1Q9Y3T6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
R3HCC1Q9Y3T6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
R3HCC1Q9Y3T6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
R3HCC1Q9Y3T6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
R3HCC1Q9Y3T6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
R3HCC1Q9Y3T6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
R3HCC1Q9Y3T6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
R3HCC1Q9Y3T6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
R3HCC1Q9Y3T6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
R3HCC1Q9Y3T6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
R3HCC1Q9Y3T6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.17■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
R3HCC1Q9Y3T6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
R3HCC1Q9Y3T6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
R3HCC1Q9Y3T6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms