Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B2

EXOSC1, Exosome complex component CSL4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC1Q9Y3B2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EXOSC1Q9Y3B2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EXOSC1Q9Y3B2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC1Q9Y3B2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EXOSC1Q9Y3B2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EXOSC1Q9Y3B2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EXOSC1Q9Y3B2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EXOSC1Q9Y3B2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EXOSC1Q9Y3B2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EXOSC1Q9Y3B2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EXOSC1Q9Y3B2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EXOSC1Q9Y3B2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC1Q9Y3B2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC1Q9Y3B2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1141.4 ms