Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2X3

NOP58, Nucleolar protein 58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP58Q9Y2X3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.47■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
NOP58Q9Y2X3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
NOP58Q9Y2X3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NOP58Q9Y2X3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
NOP58Q9Y2X3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
NOP58Q9Y2X3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
NOP58Q9Y2X3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
NOP58Q9Y2X3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NOP58Q9Y2X3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NOP58Q9Y2X3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NOP58Q9Y2X3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
NOP58Q9Y2X3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NOP58Q9Y2X3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NOP58Q9Y2X3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NOP58Q9Y2X3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NOP58Q9Y2X3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
NOP58Q9Y2X3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
NOP58Q9Y2X3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NOP58Q9Y2X3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NOP58Q9Y2X3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NOP58Q9Y2X3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
NOP58Q9Y2X3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NOP58Q9Y2X3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms