Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ05

KCNH4, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH4Q9UQ05 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNH4Q9UQ05 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
KCNH4Q9UQ05 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
KCNH4Q9UQ05 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
KCNH4Q9UQ05 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
KCNH4Q9UQ05 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNH4Q9UQ05 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
KCNH4Q9UQ05 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
KCNH4Q9UQ05 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
KCNH4Q9UQ05 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
KCNH4Q9UQ05 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
KCNH4Q9UQ05 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
KCNH4Q9UQ05 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KCNH4Q9UQ05 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
KCNH4Q9UQ05 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
KCNH4Q9UQ05 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
KCNH4Q9UQ05 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
KCNH4Q9UQ05 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.67■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
KCNH4Q9UQ05 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KCNH4Q9UQ05 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
KCNH4Q9UQ05 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms