Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SATB2Q9UPW6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SATB2Q9UPW6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SATB2Q9UPW6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SATB2Q9UPW6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SATB2Q9UPW6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SATB2Q9UPW6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SATB2Q9UPW6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SATB2Q9UPW6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms