Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
SETD1BQ9UPS6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
SETD1BQ9UPS6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
SETD1BQ9UPS6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
SETD1BQ9UPS6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC40.81■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
SETD1BQ9UPS6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
SETD1BQ9UPS6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC40.74■■■■■ 4.11
SETD1BQ9UPS6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
SETD1BQ9UPS6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.68■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.67■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.66■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.63■■■■■ 4.1
SETD1BQ9UPS6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
SETD1BQ9UPS6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
SETD1BQ9UPS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SETD1BQ9UPS6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC40.59■■■■■ 4.09
SETD1BQ9UPS6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
SETD1BQ9UPS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
SETD1BQ9UPS6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SETD1BQ9UPS6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
SETD1BQ9UPS6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC40.52■■■■■ 4.08
SETD1BQ9UPS6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
SETD1BQ9UPS6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SETD1BQ9UPS6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.44■■■■■ 4.06
SETD1BQ9UPS6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
SETD1BQ9UPS6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SETD1BQ9UPS6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
SETD1BQ9UPS6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
SETD1BQ9UPS6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
SETD1BQ9UPS6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SETD1BQ9UPS6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
SETD1BQ9UPS6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.37■■■■■ 4.05
SETD1BQ9UPS6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
SETD1BQ9UPS6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC40.35■■■■■ 4.05
SETD1BQ9UPS6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
SETD1BQ9UPS6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
SETD1BQ9UPS6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
SETD1BQ9UPS6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
SETD1BQ9UPS6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
SETD1BQ9UPS6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
SETD1BQ9UPS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
SETD1BQ9UPS6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC40.25■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.22■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
SETD1BQ9UPS6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC40.19■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.19■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.17■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC40.14■■■■■ 4.02
SETD1BQ9UPS6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
SETD1BQ9UPS6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
SETD1BQ9UPS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SETD1BQ9UPS6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
SETD1BQ9UPS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.08■■■■■ 4.01
SETD1BQ9UPS6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
SETD1BQ9UPS6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC40.08■■■■■ 4.01
SETD1BQ9UPS6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
SETD1BQ9UPS6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms