Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMG5Q9UPR3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMG5Q9UPR3 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMG5Q9UPR3 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMG5Q9UPR3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMG5Q9UPR3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMG5Q9UPR3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMG5Q9UPR3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMG5Q9UPR3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
SMG5Q9UPR3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SMG5Q9UPR3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SMG5Q9UPR3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMG5Q9UPR3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMG5Q9UPR3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMG5Q9UPR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMG5Q9UPR3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms