Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FZD1Q9UP38 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
FZD1Q9UP38 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FZD1Q9UP38 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FZD1Q9UP38 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FZD1Q9UP38 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FZD1Q9UP38 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FZD1Q9UP38 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FZD1Q9UP38 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
FZD1Q9UP38 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
FZD1Q9UP38 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FZD1Q9UP38 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
FZD1Q9UP38 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FZD1Q9UP38 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FZD1Q9UP38 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FZD1Q9UP38 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FZD1Q9UP38 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
FZD1Q9UP38 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FZD1Q9UP38 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FZD1Q9UP38 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.79
FZD1Q9UP38 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FZD1Q9UP38 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.38■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
FZD1Q9UP38 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FZD1Q9UP38 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
FZD1Q9UP38 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FZD1Q9UP38 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
FZD1Q9UP38 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
FZD1Q9UP38 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
FZD1Q9UP38 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
FZD1Q9UP38 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
FZD1Q9UP38 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
FZD1Q9UP38 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
FZD1Q9UP38 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
FZD1Q9UP38 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FZD1Q9UP38 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.04■■■□□ 2.72
FZD1Q9UP38 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FZD1Q9UP38 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms