Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNE0

EDAR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member EDAR, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDARQ9UNE0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EDARQ9UNE0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
EDARQ9UNE0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EDARQ9UNE0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EDARQ9UNE0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
EDARQ9UNE0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EDARQ9UNE0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EDARQ9UNE0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms