Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ3

PTPRQ, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, humanhuman

Predictions only

Length 2,332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRQQ9UMZ3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PTPRQQ9UMZ3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PTPRQQ9UMZ3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PTPRQQ9UMZ3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PTPRQQ9UMZ3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PTPRQQ9UMZ3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PTPRQQ9UMZ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTPRQQ9UMZ3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTPRQQ9UMZ3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PTPRQQ9UMZ3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PTPRQQ9UMZ3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PTPRQQ9UMZ3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PTPRQQ9UMZ3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPRQQ9UMZ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms