Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV8

CBLC, E3 ubiquitin-protein ligase CBL-C, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLCQ9ULV8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CBLCQ9ULV8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBLCQ9ULV8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBLCQ9ULV8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBLCQ9ULV8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBLCQ9ULV8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CBLCQ9ULV8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CBLCQ9ULV8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CBLCQ9ULV8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CBLCQ9ULV8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms