Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULU4

ZMYND8, Protein kinase C-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZMYND8Q9ULU4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZMYND8Q9ULU4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZMYND8Q9ULU4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZMYND8Q9ULU4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZMYND8Q9ULU4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZMYND8Q9ULU4 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZMYND8Q9ULU4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
ZMYND8Q9ULU4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZMYND8Q9ULU4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
ZMYND8Q9ULU4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ZMYND8Q9ULU4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZMYND8Q9ULU4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZMYND8Q9ULU4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
ZMYND8Q9ULU4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZMYND8Q9ULU4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZMYND8Q9ULU4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZMYND8Q9ULU4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZMYND8Q9ULU4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZMYND8Q9ULU4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ZMYND8Q9ULU4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZMYND8Q9ULU4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZMYND8Q9ULU4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZMYND8Q9ULU4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ZMYND8Q9ULU4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ZMYND8Q9ULU4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC30.38■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
ZMYND8Q9ULU4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ZMYND8Q9ULU4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ZMYND8Q9ULU4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ZMYND8Q9ULU4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms