Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ZNRF3Q9ULT6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNRF3Q9ULT6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ZNRF3Q9ULT6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ZNRF3Q9ULT6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNRF3Q9ULT6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNRF3Q9ULT6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNRF3Q9ULT6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNRF3Q9ULT6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNRF3Q9ULT6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNRF3Q9ULT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNRF3Q9ULT6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNRF3Q9ULT6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ZNRF3Q9ULT6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNRF3Q9ULT6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNRF3Q9ULT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNRF3Q9ULT6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNRF3Q9ULT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNRF3Q9ULT6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNRF3Q9ULT6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNRF3Q9ULT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.01■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
ZNRF3Q9ULT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ZNRF3Q9ULT6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNRF3Q9ULT6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNRF3Q9ULT6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ZNRF3Q9ULT6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ZNRF3Q9ULT6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms