Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
MYH13Q9UKX3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
MYH13Q9UKX3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
MYH13Q9UKX3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
MYH13Q9UKX3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
MYH13Q9UKX3 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
MYH13Q9UKX3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MYH13Q9UKX3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.7■■■□□ 2.83
MYH13Q9UKX3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MYH13Q9UKX3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms