Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV3

ACIN1, Apoptotic chromatin condensation inducer in the nucleus, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACIN1Q9UKV3 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
ACIN1Q9UKV3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
ACIN1Q9UKV3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ACIN1Q9UKV3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
ACIN1Q9UKV3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC40.54■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
ACIN1Q9UKV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ACIN1Q9UKV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ACIN1Q9UKV3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ACIN1Q9UKV3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
ACIN1Q9UKV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ACIN1Q9UKV3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
ACIN1Q9UKV3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
ACIN1Q9UKV3 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ACIN1Q9UKV3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ACIN1Q9UKV3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ACIN1Q9UKV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
ACIN1Q9UKV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ACIN1Q9UKV3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC40.32■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ACIN1Q9UKV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC40.29■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC40.29■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
ACIN1Q9UKV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.21■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.2■■■■■ 4.03
ACIN1Q9UKV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.18■■■■■ 4.02
ACIN1Q9UKV3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.17■■■■■ 4.02
ACIN1Q9UKV3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ACIN1Q9UKV3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
ACIN1Q9UKV3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC40.04■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC40.02■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC40.01■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ACIN1Q9UKV3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40■■■■□ 3.99
ACIN1Q9UKV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
ACIN1Q9UKV3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ACIN1Q9UKV3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
ACIN1Q9UKV3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
ACIN1Q9UKV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ACIN1Q9UKV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.93■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC39.91■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC39.88■■■■□ 3.98
ACIN1Q9UKV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.1 ms