Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT1

TUBD1, Tubulin delta chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBD1Q9UJT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TUBD1Q9UJT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TUBD1Q9UJT1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TUBD1Q9UJT1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TUBD1Q9UJT1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TUBD1Q9UJT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBD1Q9UJT1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBD1Q9UJT1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBD1Q9UJT1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms