Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ9

PGAP2, Post-GPI attachment to proteins factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP2Q9UHJ9 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PGAP2Q9UHJ9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PGAP2Q9UHJ9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PGAP2Q9UHJ9 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PGAP2Q9UHJ9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PGAP2Q9UHJ9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
PGAP2Q9UHJ9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PGAP2Q9UHJ9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PGAP2Q9UHJ9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
PGAP2Q9UHJ9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PGAP2Q9UHJ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
PGAP2Q9UHJ9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
PGAP2Q9UHJ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
PGAP2Q9UHJ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
PGAP2Q9UHJ9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC33.06■■■□□ 2.88
PGAP2Q9UHJ9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PGAP2Q9UHJ9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
PGAP2Q9UHJ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
PGAP2Q9UHJ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PGAP2Q9UHJ9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
PGAP2Q9UHJ9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
PGAP2Q9UHJ9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PGAP2Q9UHJ9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
PGAP2Q9UHJ9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PGAP2Q9UHJ9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
PGAP2Q9UHJ9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
PGAP2Q9UHJ9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC32.78■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
PGAP2Q9UHJ9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PGAP2Q9UHJ9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PGAP2Q9UHJ9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PGAP2Q9UHJ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
PGAP2Q9UHJ9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
PGAP2Q9UHJ9 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PGAP2Q9UHJ9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
PGAP2Q9UHJ9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms