Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC3

ASIC3, Acid-sensing ion channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC3Q9UHC3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ASIC3Q9UHC3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC3Q9UHC3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ASIC3Q9UHC3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ASIC3Q9UHC3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC3Q9UHC3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ASIC3Q9UHC3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ASIC3Q9UHC3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ASIC3Q9UHC3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ASIC3Q9UHC3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ASIC3Q9UHC3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
ASIC3Q9UHC3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
ASIC3Q9UHC3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
ASIC3Q9UHC3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
ASIC3Q9UHC3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC3Q9UHC3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC3Q9UHC3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
ASIC3Q9UHC3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ASIC3Q9UHC3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms