Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TCF20Q9UGU0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TCF20Q9UGU0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
TCF20Q9UGU0 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
TCF20Q9UGU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TCF20Q9UGU0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TCF20Q9UGU0 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCF20Q9UGU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCF20Q9UGU0 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCF20Q9UGU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TCF20Q9UGU0 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TCF20Q9UGU0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TCF20Q9UGU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TCF20Q9UGU0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TCF20Q9UGU0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TCF20Q9UGU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TCF20Q9UGU0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TCF20Q9UGU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TCF20Q9UGU0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms