Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CACFD1Q9UGQ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACFD1Q9UGQ2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CACFD1Q9UGQ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACFD1Q9UGQ2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CACFD1Q9UGQ2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CACFD1Q9UGQ2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CACFD1Q9UGQ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms