Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU3

GHRL, Appetite-regulating hormone, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GHRLQ9UBU3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GHRLQ9UBU3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GHRLQ9UBU3 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHRLQ9UBU3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHRLQ9UBU3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GHRLQ9UBU3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GHRLQ9UBU3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GHRLQ9UBU3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GHRLQ9UBU3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GHRLQ9UBU3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GHRLQ9UBU3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GHRLQ9UBU3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GHRLQ9UBU3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms