Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CTNNAL1Q9UBT7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CTNNAL1Q9UBT7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CTNNAL1Q9UBT7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CTNNAL1Q9UBT7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CTNNAL1Q9UBT7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNAL1Q9UBT7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CTNNAL1Q9UBT7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTNNAL1Q9UBT7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTNNAL1Q9UBT7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTNNAL1Q9UBT7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CTNNAL1Q9UBT7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CTNNAL1Q9UBT7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.8 ms