Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR5

CKLF, Chemokine-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKLFQ9UBR5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CKLFQ9UBR5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CKLFQ9UBR5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CKLFQ9UBR5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CKLFQ9UBR5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CKLFQ9UBR5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CKLFQ9UBR5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKLFQ9UBR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKLFQ9UBR5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKLFQ9UBR5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKLFQ9UBR5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKLFQ9UBR5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms