Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE8

NLK, Serine/threonine-protein kinase NLK, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLKQ9UBE8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NLKQ9UBE8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLKQ9UBE8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NLKQ9UBE8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NLKQ9UBE8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NLKQ9UBE8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NLKQ9UBE8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NLKQ9UBE8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.5 ms