Protein–RNA interactions for Protein: Q9P253

VPS18, Vacuolar protein sorting-associated protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS18Q9P253 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
VPS18Q9P253 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
VPS18Q9P253 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
VPS18Q9P253 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
VPS18Q9P253 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
VPS18Q9P253 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
VPS18Q9P253 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
VPS18Q9P253 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
VPS18Q9P253 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
VPS18Q9P253 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms