Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
H2AFY2Q9P0M6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2AFY2Q9P0M6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2AFY2Q9P0M6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2AFY2Q9P0M6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2AFY2Q9P0M6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
H2AFY2Q9P0M6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H2AFY2Q9P0M6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2AFY2Q9P0M6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms