Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HACD3Q9P035 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
HACD3Q9P035 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HACD3Q9P035 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HACD3Q9P035 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HACD3Q9P035 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
HACD3Q9P035 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HACD3Q9P035 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HACD3Q9P035 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HACD3Q9P035 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms