Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EHD3Q9NZN3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EHD3Q9NZN3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EHD3Q9NZN3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EHD3Q9NZN3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EHD3Q9NZN3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EHD3Q9NZN3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EHD3Q9NZN3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
EHD3Q9NZN3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EHD3Q9NZN3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms