Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RHBDL2Q9NX52 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RHBDL2Q9NX52 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RHBDL2Q9NX52 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RHBDL2Q9NX52 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RHBDL2Q9NX52 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RHBDL2Q9NX52 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RHBDL2Q9NX52 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms