Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR7

TBCCD1, TBCC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBCCD1Q9NVR7 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TBCCD1Q9NVR7 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBCCD1Q9NVR7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBCCD1Q9NVR7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBCCD1Q9NVR7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBCCD1Q9NVR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TBCCD1Q9NVR7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TBCCD1Q9NVR7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TBCCD1Q9NVR7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TBCCD1Q9NVR7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TBCCD1Q9NVR7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TBCCD1Q9NVR7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TBCCD1Q9NVR7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms