Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
UFSP2Q9NUQ7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
UFSP2Q9NUQ7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
UFSP2Q9NUQ7 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UFSP2Q9NUQ7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
UFSP2Q9NUQ7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UFSP2Q9NUQ7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
UFSP2Q9NUQ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFSP2Q9NUQ7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms