Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PNPLA3Q9NST1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PNPLA3Q9NST1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PNPLA3Q9NST1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PNPLA3Q9NST1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
PNPLA3Q9NST1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PNPLA3Q9NST1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
PNPLA3Q9NST1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PNPLA3Q9NST1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PNPLA3Q9NST1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.6 ms