Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PCDHB16Q9NRJ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PCDHB16Q9NRJ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB16Q9NRJ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PCDHB16Q9NRJ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PCDHB16Q9NRJ7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCDHB16Q9NRJ7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms